A Unijuí possui programas de Pós-graduação com cursos de Mestrado e Doutorado autorizados pela CAPES. Estes programas constituem um espaço reconhecido e já consolidado de formação de profissionais da educação de alto nível na região noroeste do Estado do Rio Grande do Sul.

Este é o lugar adequado para quem busca oportunidade de formação qualificada, através da reflexão crítica e da realização de projetos de investigação em diferentes áreas do conhecimento.